De Viswaterrichtlijn (2006/44/EG) en de Schelpdierwaterrichtlijn (2006/113/EG) uit 2006 worden beiden ingetrokken op 22 december 2013. Dit bepaalt de Kaderrichtlijn Water (KRW) uit 2000. Artikel 22, punt 2 vermeldt dat de richtlijnen uit 1987 15 jaar na inwerkingtreding van de KRW worden ingetrokken. Bepalingen over de bescherming van deze typen wateren zijn opgenomen in de KRW.