Decentrale overheden hebben te maken met Europese richtlijnen gerelateerd aan industrie, met name via het verstrekken van vergunningen en het controleren van de naleving ervan. 

Wet- en regelgeving: IPPC- en IED-richtlijn
Tot 2011 was de Europese regelgeving voor industriële emissies vervat in de Richtlijn inzake geïntegreerde preventie en bestrijding van verontreiniging, oftewel de IPPC-richtlijn (afkorting van Integrated Pollution Prevention and Control, 96/61/EG en 2008/1/EG). Deze richtlijn verplichtte de Europese lidstaten grote milieuvervuilende bedrijven te reguleren met een integrale vergunning voor alle mogelijke soorten van vervuiling, op basis van Best Beschikbare Technieken (BBT’s). 

Nieuwe IED-richtlijn
Op 21 december 2007 heeft de Europese Commissie een herzien voorstel van de IPPC-richtlijn gelanceerd waarover in 2010 overeenstemming is bereikt. Deze Richtlijn Industriële Emissies (Industrial Emissions Directive (IED)) integreert de IPPC- en zes andere richtlijnen (de Richtlijn grote stookinstallaties, de Afvalverbrandingsrichtlijn, de Oplosmiddelenrichtlijn en drie Richtlijnen voor de titaniumdioxide-industrie). 

Volgens dossier 2.5 van de IPO-KEM/KMR matrix is in de IED-richtlijn ten opzichte van de IPPC-richtlijn onder meer sprake van verduidelijking van de scope (o.a. definitie installatie, waterzuiveringsinstallaties en afvalbeheer), aanscherping van de toepassing van de BREF (referentie) documenten, bepalingen over de actualisatie van vergunningen, en een verruiming van de mogelijkheid van het stellen van algemene regels.

De IED is op 6 januari 2011 in werking getreden. Lidstaten hebben twee jaar de tijd om de nieuwe richtlijn in nationale wetgeving te implementeren. 

Implementatie in Nederland
In Nederland is de IPPC-richtlijn op 1 december 2005 geïmplementeerd in de Wet milieubeheer (Wm) en de Wet verontreiniging oppervlaktewateren (Wvo). Na de inwerkingtreding van de Waterwet is de implementatiewetgeving veranderd: de IPPC-Wvo-vergunningen zijn vrijwel allemaal onder het WM-bevoegd gezag komen de vallen. 

Het ministerie van I&M implementeert de IED-richtlijn. Om dit correct te doen, wordt in Nederland naar verwachting een groot aantal regels aangepast, zoals de Wabo, Wm, Waterwet, Wet ammoniak en veehouderij, (wellicht) Wet bodembescherming en uitvoeringsbesluiten en een flink aantal gerelateerde besluiten.